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CancerSEA**:这是首个致力于单细胞测序的数据库,专注于探索癌症细胞在单细胞水平上的不同功能状态。其数据来源于主流生物数据平台,覆盖了41900个肿瘤细胞和14种功能状态的定义。用户可以通过这个数据库进行基因搜索、状态搜索、浏览状态图谱等操作,为研究者提供了一个全面的肿瘤细胞功能分析平台。
首先,CancerSEA 是一个专为单细胞测序数据设计的数据库,它收集了72个数据集中的单细胞测序结果,涵盖25种癌症的41900个肿瘤细胞。通过与HCMDB、Cyclebase和StemMapper等数据库的整合,CancerSEA数据库能够提供丰富的功能状态注释,支持用户进行基因搜索、状态搜索、浏览状态图谱、查看数据集信息和下载数据。
作者进一步分析了TGFβ2表达与癌症预后的关系,通过PrognoScan数据库和Kaplan-Meier Plotter数据库进行数据挖掘。PrognoScan数据库复现 访问PrognoScan数据库(dna00.bio.kyutech.ac.jp...),输入分子“TGFB2”,分析不同癌症类型中TGFβ2与患者预后的关联性。图2A-H的分析结果可在此数据库中找到。
GSCA数据库主要分为四个模块:基因表达模块、免疫模块、突变模块和药物模块。在基因表达模块中,用户可进行单基因分析和多基因/基因家族分析。通过选择基因集、癌症类型和分析类型,提交请求后即可获取基因表达差异结果。
关于数据库的使用方法,首先可以通过网站访问(cptac-data-portal.georgetown.edu...)来获取数据,通过搜索工具输入感兴趣的癌症类型、蛋白质或基因名称,即可得到转录组和蛋白质组数据、元数据和临床数据。以结直肠癌为例,进入后会看到多种筛选类型,右侧分别展示了样本介绍和数据文件描述。
SCI和SSCI是两大数据库,前者收录理工科文章,后者则覆盖人文社科。SSCI发表难度大于SCI,原因在于: **语言门槛**。SSCI文章平均篇幅较长,对非英语母语作者的书面表达能力要求更高。 **研究方法复杂性**。人文社科研究对象多样,问题定义和量化难度大,分析过程复杂,难以得出明确结论。
定义:SCI是指科学引文索引,而SSCI是指社会科学引文索引。可以说,SSCI是SCI的一个子集,主要涵盖社会科学领域的文献。
SCI与SSCI的区别,主要在于学科领域。SCI聚焦于理工科,而SSCI则着重于人文社科。SSCI的获取难度相对较高,其原因包括期刊价格昂贵、数量有限、主要面向国际学者、对英语水平要求高、文章长度更长、审稿周期长,以及对研究方法的严格要求。这些因素导致SSCI的发表对于国内学者来说,相较于SCI,更具挑战性。
sci的审稿周期通常为3~7个月,相比之下,ssci的审稿周期更长,平均6个月以上。sci期刊数量多,大部分为国内期刊,审稿人易于理解,因而发表难度相对较小。而ssci期刊主要为国外,由于文化差异,审稿人可能不熟悉中国研究背景,故发表难度较大。
ssci和sci有什么区别如下: SSCI和SCI期刊属于国际期刊,在国际期刊中SSCI和SCI论文质量要求较高,所以比国内论文发表难度和要求高一些。为了保证能够顺利发表SSCI和SCI期刊,建议作者在发表SSCI和SCI期刊之前,一定要清楚SSCI和SCI期刊有什么区别,然后根据自己论文实际需求,选择合适自己论文期刊,具体详情如下。
SSCI和SCIE在收录范围和影响因子方面有明显的区别。首先,SSCI,即社会科学引文索引,主要收录的是社会科学领域的期刊,涵盖了经济学、心理学、社会学、政治学等学科。而SCIE,即科学引文索引扩展版,收录的是自然科学领域的期刊,包括生物、物理、化学、医学等学科。
在科研领域,经常会听到诸如SCI、SSCI、EI、CPCI等学术术语,这些其实是指被多个知名英文文献数据库收录的论文。其中,SCI、SSCI、EI和CPCI是国际公认的科技和社科文献评价工具,而国内的知网、维普和万方则主要收录中文文献。
CPCI即ConferenceProceedingsCitationIndex,翻译成中文就是:会议录引文索引。原称ISTP(科学会议录索引)。主要收录国际上著名的科技会议文献。CPCI可分为两个子数据库,一个是收录理工科方向的叫CPCI-S,另一个是收录社科方向的叫CPCI-SSH。
发表论文的期刊等级越高,影响力越大,对作者在学术深造、职称晋升等方面的影响也更显著。我们常看到的SCI/SSCI论文、中文核心期刊论文、EI、CPCI、Scopus论文、中英文普刊论文,这些英文表达是英文文献数据库的名称。例如,SCI论文指的是被SCI数据库收录的论文。
各类数据库缩写中,CI代表Citation Index,即引文索引,是用于文献收录与检索的工具。其中,SCI、SSCI、EI、CPCI、CSSCI等数据库因其高认可度而受到重视。这几种数据库各有侧重:SCI主要收录自然科学类期刊,涵盖领域广泛。SSCI相较于SCI多了一个“S”字母,代表“社会科学引文索引”,收录社会科学类期刊。
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